肾结石引起的疼痛可分为钝痛和绞痛。40%-50%的病人都有间隙发作的疼痛史。疼痛常位于腰部和腹部，多数呈阵发性，亦可为持续疼痛。有的疼痛可能仅表现为腰部酸胀不适，活动或劳动可促使疼痛发作或加重。
肾结石疼痛在医学上被分为是11级疼痛，是内脏疼痛。医学上最严重的疼痛分级是12级，就是母亲的分娩痛。内脏疼痛仅次于分娩痛。肾结石的疼痛一般都是因为结石排泄过程中导致输尿管痉挛，肾脏积水，疼痛呈阵发性绞痛，疼痛向下腹部膀胱区及后腰部放散，同时有血尿，还伴有恶心呕吐胃内容物。患者因疼痛辗转反侧，痛不欲生。
肾结石可以药物治疗缓解疼痛，肾结石发生疼痛，称之为肾绞痛。发生的主要机制是因为结石从肾脏长成之后，通过输尿管排出，然后堵塞输尿管引起痉挛性的疼痛，疼痛分为1-12级。
如果有肾结石是表现为腰部的酸胀不适，而且腹部会有隐痛，如果活动或者是走动可能疼痛会发作或者加剧，严重患者会脸色惨白，而且同时会出冷汗，严重可能会有休克的状态，同时还会有恶心呕吐和腹胀便秘的症状，而且还会有排泄功能的故障。
肾结石疼痛可以靠药物止痛，如果再严重，有些人除疼痛，还有恶心呕吐，根本吃不下药物，就需要肌注，还有一种办法，就是插双J管做膀胱镜，通过尿道、膀胱，插管道到肾盂，解除梗阻，可以缓解疼痛。
结石通常都分为胆囊结石以及肾结石，通常结石疼痛的时候都会以绞痛为主。一般都必须要应用药物处理，常用的就是中枢性的镇痛药，一般对孕妇和胎儿没有产生太大的影响，一般选用的是肌肉注射曲马多、颅痛定或者静脉注射地佐辛中枢镇痛治疗。另外，也可以给予用中医的传统针灸疗法，也有一定的效果，例如用平衡针的腰痛穴、胆囊穴以及后溪穴，对胆囊以及腰痛都有止痛的作用。