选择手术的方式不同，费用也有很大差异，比如做一些微创的手术就费用比较高，还有一些开创性的手术，剩余的手术就需要通过肾盂切开取石手术，治疗输尿管的结石也需要通过切开输尿管等方式进行治疗。
是经皮碎石取石治疗，花费大一些，不同的医院花费也不尽相同，到当地医院泌尿外科进一步咨询，术后多饮水，多排尿，多运动，辅助以排石类中成药辅助排石治疗。治疗的费用各个地区差异的不大的。
一般情况下，肾结石的微创外科治疗方法和费用都是有区别的。在三甲医院的肾脏镜下腔内，有2600元的外科手术和2000元的麻醉费。经过输尿管软镜下的钬激光碎石，要做3000元的手术，要进行全麻。经皮肾结石的治疗是在腰椎处开一个1cm的人工开凿的小孔，以便进行结石清除。输尿管的软镜下，使用的是微创技术，不需要制作人造肾脏，而是通过尿道进入输尿管，进入肾脏。建议患者结合自己的实际情况来选择合适的手术。
使用体外碎石一般需要千元左右不等，具体费用应当去治疗的医院进行咨询。做肾结石手术的费用要根据结石的大小进行判断。如果结石小于0.6厘米可以选择口服药物进行治疗。在0.6~2厘米之间的结石需要进行体内碎石或者输尿管镜取结石。
做个肾结石手术需要两个小时左右。得根据结石大小，位置决定手术时间，肾结石的经皮肾镜手术或者输尿管软镜手术，是治疗结石的微创手术的伤害非常小手术后超过一周就基本恢复正常。