尿分叉是一种偶然的、暂时性的，与生理上的病因没有关系。
最多的情况是一晚后，早上小便会出现分岔，这是由于尿液在膀胱里堆积，压力过大，小便时用力过猛，造成尿道口形状临时发生变化，出现尿分叉，另外，射精后，由于一些精液残留在尿道中，会造成尿分岔。一般的病理性尿分叉是多种原因引起的，主要是因为残尿分叉是由后尿道和尿道口的狭窄引起的，而这些疤痕会造成尿液无法顺畅地排泄，从而引起尿道炎、前列腺炎等。
尿分叉的主要原因有前列腺炎，分泌物堵塞尿道，排尿时因尿道粘连出现尿分叉。是临床上比较常见的原因之一。病人同时会有尿频尿急尿不尽，下腹坠胀等不适症状。还有尿道炎也会造成尿分叉，因为尿道炎有大量的分泌物，导致尿道水肿，导致尿分叉。病人有排尿不畅感，有排尿刺痛症状。尿分叉也见在阴茎勃起后，挤压尿道出现排尿分叉症状。
排尿分叉的原因有很多，具体分析如下：
出现分叉的原因有很多种，比如手淫、前列腺炎等，可以到泌尿外科做前列腺液和泌尿系统彩超。尿道口粘膜有轻微粘连，导致排尿分叉。尿道有结石也可以引起这种症状，比如外尿道口阻塞，尿路会出现分岔，并伴有血尿、尿痛等症状。尿道分岔还会导致尿道口粘膜的肿瘤和息肉。平时要多喝水、多排尿等。
导致尿分叉，原因是尿道口有堵塞的东西，如息肉、肿瘤或者尿道口囊肿、尿道口有感染，导致尿道口有分泌物，都会堵塞尿道口，导致尿分叉。另外，男性尿分叉最常见的原因，是男性前列腺炎、前列腺增生。
男性尿分叉常见的危害有：反复发作性尿道炎者，长时间后部分尿道内膜组织形成瘢痕，致使局部尿道狭窄造成排尿不畅。还有是急性尿道炎、前列腺炎期间，由于尿道充血、肿胀、分泌物增多，也可影响尿液的通畅而出现分叉现象。男性尿分叉的危害是很多的，唯有及时接受诊治，才是避免危害扩大化的方法。