常见的临床症状有寒战、发热、尿频、尿急、尿痛及排尿困难，甚至发生急性尿潴留。直肠指检可扪及前列腺有多发或单发硬性结节。近期发生急性尿路感染，继而下尿路梗阻，同时前列腺迅速增大、变硬，出现硬结，血PSA可能升高，B超发现前列腺内低回声结节或前列腺增大、密度不均，应考虑到肉芽肿性前列腺炎的可能。
肉芽肿性前列腺炎的症状都较典型，均有反复发作的下尿路感染病史，部分有前列腺创伤史或过敏性疾病史。常见的临床症状有寒战、发热、尿频、尿急、尿痛及排尿困难，甚至发生急性尿潴留。直肠指检可扪及前列腺有多发或单发硬性结节。
临床特点是术前无感染病史，临床上又无炎症表现，也无病灶周围组织器官感染迹象，起病及临床表现均与肿瘤相似，故常误诊为肿瘤。非特异性炎症性肉芽肿的成因是由于机体抵抗力强，致病菌毒力较弱，局部感染程度较轻，脓液较少，甚至完全无脓液而逐渐形成炎性肉芽组织。
肉芽肿性前列腺炎有急性和慢性之分，急性发病突然，有寒战和高热，尿频尿急，尿痛，会阴部坠胀感，可发生排尿困难或急性尿潴留。慢性有排尿改变，尿不净，尿等待，有时分叉，性生活时有尿急感，排尿后和便后常有白色分泌物排出，俗称滴白，性功能减退，如阳痿，早泄等。
下尿路感染：其中有83%的病人同时伴有十分明显的下尿路感染症状，常见的有发热、寒战、尿频、尿道烧灼感、尿痛等，偶见血尿、会阴痛、耻骨上不适。其它症状：大部分表现为排尿困难或梗阻症状，其他表现为腰骶、膀胱区、腹股沟及会阴等处胀痛不适、睾丸、附睾炎等。这种疾病的肿块发展较快，结节较大，有弹性，不规则，软硬不一致。
轻微的肉芽肿性前列腺炎的症状有发热、寒战、尿频、尿道烧灼感、尿痛，偶见血尿、会阴痛、耻骨上不适。直肠指检：肉芽肿性前列腺炎肿块一般发展较快，结节较大，有弹性，不规则，软硬不一致。