物理方面治疗男性阴茎短小的问题是不科学的，男性的阴茎在18岁之后就已经发育完全，是不会在二次发育的，物理治疗的方式也是达不到治疗的效果，唯一一种办法是通过手术治疗，通过延长手术可以使阴茎延长3-5公分左右，其他方法都不可以采用。
如果有正常的功能的情况下，做手术时是较为慎重的，考虑用悬韧带手术，切断悬韧带，使其增长；还有一种就是增粗，通过使用一些人工材料，包绕在阴茎的外侧即皮下使其增粗，最常见的材料就是高泰克斯或者膨体，都可以制成特殊形态，包绕在阴茎外面，使其在视觉上达到增粗的效果。
阴茎已经发育成熟了，不能再次发育了，阴茎增大器没什么用，如果不满意，只能采用阴茎延长术治疗。男性阴茎的长度、直径以及勃起后的角度等个体差异较大，目前除了手术延长之外，尚无其他有效的方法延长。
对于青春期前的，如果有阴茎短小，要看一下是否有内分泌疾病所致，比如脑垂体疾病，导致睾酮分泌减少，如果及时补充睾酮，可以在青春期有正常的发育。另外是否有先天性的畸形，比如尿道上裂或者尿道下裂的。
阴茎大小和遗传因素有关，一般勃起后阴茎不小于8厘米的，就没问题，目前并没有任何药物或仪器有增大增粗阴茎办法，平时可坚持运动锻炼，调整心态，吃补肾的食物等方式可以提高性生活持久力。
阴茎的发育主要是靠激素水平或阴茎海绵体自身发育来维持的。成人的生殖器勃起时在8~10厘米以上是一个合理的范围。可以到专业的泌尿外科或男科来检查激素水平或阴茎海绵体血流多普勒，这样才能做出一个明确的判断。