应根据病原菌的种类及对药物的敏感性，有针对性地选用2～3种药物联合应用，这样疗效较好。待症状完全消失，尿液检查正常，细菌培养阴性后用药应持续7～10天方可停药。另外急性尿道炎期病人应多饮水以增加尿量，对尿道有冲洗作用。
快速治疗尿道炎一般是使用敏感的抗生素来进行治疗，敏感的抗生素可以很快的缓解病人的症状，在缓解症状治好还需要继续使用一段时间的药，一般要使用一周到两周的时间，才可以停药，要不然尿道炎是很容易反复发生的。
对于由不同病原微生物感染引起的尿道炎，使用的抗生素有时略有不同，不同人可能使用的抗生素类型也略有不同。由于有些病人可能滥用药物，有些病人可能对同类抗生素敏感，有时不得不根据治疗尿道炎的个体差异制定个体治疗计划。多喝水、多排尿、多吃一些新鲜的蔬菜和水果、不吃辛辣刺激的食物，对治疗是有帮助，也可以加快病人的康复。
如果患有尿道炎，可以用抗生素来进行治疗，在治疗期间一定要多喝水，多排尿，有助于病情的恢复，注意个人清洁卫生。如果尿道炎比较严重的可以输液治疗，可以注射点滴，治疗期间要禁止同房，避免病情加重，饮食上要注意吃的清淡一些，忌辛辣刺激性的食物，注意保暖，不要着凉。
若不注意局部卫生和性生活卫生、治疗不彻底、治疗期间同房或患有阴道炎等妇科炎症时，常可导致尿道炎反复发作不愈。由于患者经常用药治疗炎症，且炎症反复发作，有可能产生了耐药性。建议进行尿培养药敏试验的检查，根据培养结果选择敏感药物进行治疗，才能达到目的。
甲硝唑属于抗滴虫和抗厌氧菌感染的药物，也就是甲硝唑对滴虫以及厌氧菌有效。临床中常见的尿道炎是由于普通的细菌感染所引起，如大肠杆菌，所以甲硝唑对这一部分尿道炎的治疗是无效的。