一般来说，阴茎上长肉芽可以使用激光或者冷冻的方式切除。
阴茎有肉芽可能是炎症刺激，赘生物或是湿疣的情况，这是一种性传播疾病，确定是尖锐湿疣引起的，建议可以选择用激光或者冷冻的方法，去除局部的疣体。建议患者这段时间要禁止性生活，建议营养均衡，不要吃辛辣刺激食物，局部清洁卫生，属于良性病变，注意观察即可。
阴茎上长个小肉芽，首先要高度怀疑是尖锐湿疣引起的。
尖锐湿疣分布在阴茎的包皮、龟头、尿道口，甚至阴囊、肛门周围等，表现为乳头样或者菜花样的突起，表面可有分泌物，表面不光滑，触碰时可有轻度的疼痛感，并且触碰时可能存在有出血。如果患者发现自身存在此现象，需要及时前往医院就诊，治疗上用抗病毒的药物治疗，还需使用免疫抑制剂，阴茎上的小肉芽则需要通过手术去除。
引起阴茎上小肉芽的常见原因有：珍珠疹、尖锐湿疣、假性湿疣、息肉等。去医院行体格检查、醋酸白试验等检查确诊，必要时行激光术或冷冻术后行组织病理检查确定性质，平时注意局部清洁卫生。
阴茎肉芽复发的症状，开始为细小的淡红色丘疹，以后逐渐增大，数目增多，表面隆起，多数质地脆而硬，高低不平的疣状增生，临床上依其形态分为蕈状、鸡冠状、菜花状、乳头状。随着时间的延长，病人传染性降低，复发的可能性亦降低。病人经治疗后6个月不复发，就算临床治好了。
阴茎上长肉芽是尖锐湿疣，具体分析如下：
由于患者一个月内有不洁的性接触史，感染了人乳头瘤状病毒引起的尖锐湿疣引发阴茎上长肉芽。建议患者出现相应症状后及时到医院进行检查，明确病因后进行针对治疗。如果是尖锐湿疣，可以使用干扰素软膏来治疗，以免复发。
建议患者在日常生活中注重私处卫生的护理工作，保证皮肤清洁卫生，穿全棉内裤，治疗期间不要有性生活，避免发生细菌感染。