一般来说，嘴唇内侧长透明水泡可以通过以下方法治疗。
1、药物治疗：带状疱疹在唇部黏膜形成多个水泡或融合成为大泡时，需要应用泼尼松龙、维生素B族等药物治疗。有疱疹样口疮、手足口病时，可以用聚肌胞、干扰素、阿昔洛韦等药物治疗。
2、直接摘除：唇腺导管发生阻塞，有黏液性囊肿形成时，可在局麻下直接摘除。
如果口腔里有一个透明的水泡，可以去正规的口腔科，也可以去大医院的口腔颌面外科，然后再做手术，把囊肿和腺体一起切除。如果是在口腔里出现了一个中长的透明水泡，那就是涎腺的粘液囊肿，这种囊肿是因为涎腺的导管受到损伤、狭窄或者是闭锁，导致唾液无法通过管道进入口腔，随着唾液的增多，腺体也会越来越大，最后形成一个透明的气泡。如果是在下嘴唇，那就是切除了唇腺和囊肿。如果是在舌下腺，必须将囊肿连同舌下腺一起切除，这样可以消除病因，避免再次出现。
嘴唇内侧起水泡应该多吃青菜水果，多喝水，补充维生素。嘴唇内侧起水泡可能是上火或者胃热引起的，可以多吃含维生素丰富的食物，不要吃过热、辛辣刺激性的食物，以免伤到水泡，引起疼痛。也可以用盐水漱口，或者吃一些清胃火的药物。
要注意避免吸烟喝酒，避免辛辣刺激食物，按时作息不要熬夜，手部起疱疹，痒，考虑应该是过敏性的疾病引起的症状，可以涂抹氧化锌对症治疗，注意避免接触化学物品，避免长时间接触水。
嘴唇长水泡可根据以下方法来治疗。
一般情况下，嘴唇长水泡的主要病因是病毒感染，治疗方法一般采用抗病毒治疗，通常在用药后几天之内就能使症状得到缓解。嘴唇长水泡还可能因为过敏性炎症所导致，这种情况需要进行系统的抗过敏治疗，可以在水疱没有破裂之前外擦抗过敏药膏。
建议患者在日常生活中要注意饮食清淡，不要食用辛辣、刺激等食物。