一般情况下，碘伏洗龟头是否有副作用需要根据情况进行判断，具体内容如下：
1.没有：如果患者龟头部位有炎症，可以使用稀释后的碘伏进行消毒，来消炎、镇痛、消毒。此时，碘伏洗龟头通常没有副作用。
2.有：但如果患者过量地用碘伏洗龟头，可能会导致龟头处菌群失衡，容易诱发炎症。此外，如果患者使用的碘伏浓度比较高，也可能产生副作用，可能出现疼痛、红肿等不适症状。
也可以使用碘伏消毒擦拭，不过在出现龟头炎之后，还是需要及时的进行检查，确定龟头炎的性质之后，再使用药物治疗。碘伏可以用于皮肤黏膜的消毒处理，在出现细菌感染疾病的状况下，就可以使用碘伏进行擦拭的，即使是出现龟头炎的状况。
碘伏可用于龟头，主要起消毒作用。如果有龟头炎或包皮炎症，则碘伏溶液可用于消毒。此外，平时必须注意保持清洁。如果反复发作，包皮过长，包皮过长可以考虑行包皮环切术。
龟头上有红疹，一般考虑是湿疹、丘疹、包皮龟头炎、病毒性湿疣等。而其中由于包皮过长或卫生不注意导致的炎症比较常见。对症治疗才可以，就像念珠菌感染龟头炎是不可以单纯用常规的碘伏来治疗的。
在耳内消毒时可以使用碘伏。
碘伏具有很好的清洁作用，在耳、鼻、咽喉外科手术中，耳科经常使用碘伏，对外耳道、耳道、鼓室等部位进行杀菌。目前在耳膜修补、耳内镜下鼓室置管术、耳内镜下鼓室探查、外耳道良性肿瘤切除术等方面都有很好的效果。它具有很好的杀菌力和较低的刺激性，所以被广泛地应用于皮肤粘膜的消毒，包括耳内。
