灰指甲的发生与真菌感染有关，因此建议患者选用抗真菌药物进行治疗，配合生活护理综合改善病情。
灰指甲是由真菌感染甲板或甲床所致的甲部病变，医学上叫做甲癣或甲真菌病，绝大多数患者通过外用抗真菌药物即可得到改善，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药所含的聚维酮碘和阿司匹林成分，不仅可杀菌抑菌，同时还能消炎止痒，改善灰指甲引起的不适症状。如果患者症状比较严重，出现了甲板脱落、萎缩等情况，则建议在外用抗真菌药物的同时，与口服抗真菌药物，如特比萘芬、氟康唑等进行联合治疗，可较为显著的改善灰指甲。
在日常护理方面，灰指甲患者需注意保持指（趾）甲清洁，勤剪指（趾）甲，平时尽量不要与他人共用私人物品，以免引起交叉感染。
灰指甲根据临床的类型，白色浅表型的和远端侧位甲下型，采取外用药物治疗，近端甲下型、全甲毁损型的甲板、指甲根有损害并且损害的数量超过四个以上，就采取内用药物治疗，有的情况严重但不适用内用药治疗，可以采用外用药物治疗。
花椒按照中医的功能主治来说是有杀菌的作用，因此如果用花椒水来涂灰指甲，可能会有减缓的趋势，但是也并不是所有的人对药物敏感，用花椒和盐煮水.盐具有杀菌的作用，而花椒能够除湿，很好地收敛皮肤，这对治疗脚气很好.拿个小盆，先接些凉水，将煮开了的花椒盐水适量地加入盆中.好了，温度差不多不烫脚的时候就可以拿来泡脚了.像这样用煮过的花椒盐水泡脚，每天一次，坚持使用一周，一般的脚气都能被治好。
治疗灰指甲的费用不是很高，但也有一些地方因为灰指甲的频繁复发，一直没有得到治疗，那么对症状造成的伤害更大，治疗一定更困难，所以需要完美，治疗成本就更高。
灰指甲的治疗药物主要以抗真菌药为主，包括聚维酮碘、环吡酮胺等外用药以及伊曲康唑、氟康唑等口服药，患者可结合自身病情，在医生的指导下规范用药治疗。
灰指甲是由真菌感染引起的皮肤病，该病的发生与潮湿环境、免疫力低下、甲部外伤等因素有关。在治疗方面，患者可选用亮甲复方聚维酮碘搽剂，这是治疗灰指甲的外用药，其中的聚维酮碘及阿司匹林等成分对微生物、细菌、真菌等具有很强杀伤力，同时还可抑制致病菌再生，改善患者症状。但若患者症状较为严重，可在外用药物的同时，联合特比萘芬等口服药物共同治疗，治疗效果比较显著。