扁平疣留下的褐色印子会自己消失的。扁平疣是人类乳头瘤病毒引起的皮肤上突出的病变，表面多扁平光滑，无明显不适，好发于青少年面部，手背等处。可以服用维生素C，和外用维生素涂擦，局部按摩、要注意作息有规律，多饮水，忌辛辣刺激性食物。
孕妇怀孕时患有扁平疣，是不会遗传给孩子的，扁平疣是临床皮肤科常见的一种疾病，主要是由于身体抵抗力低感染了病毒发病的，主要通过接触传播传染，没有必要因为这个担心。可以采取激光，冷冻或手术等方法治疗，对胎儿是没有影响的。
扁平疣掉了留褐色印子可通过药物等方法进行治疗。如果想让棕色印早日消失，可以用维生素E或肝素钠凝胶擦拭患处，平时不要吃辛辣食物或不要吃酱油以及醋等深色素食物。如果想好的快点局部可以擦肝素钠凝胶或者维生素E促进局部血液循环，有利于恢复。
在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
如果是在医院治疗的，一般的情况下都不会留下疤痕的。建议这几天注意休息和防晒，这个部位尽量不要沾水，也可以适当的外用点表皮生长因子凝胶，对扁平疣的恢复和预防色沉都是很有帮助的。
扁平疣是不会遗传，通常会出现皮肤有疣体同时还会扩散。一般可以通过免疫调节剂，主要是可以用转移的因子，同时也可以通过外用软膏治疗，还可以通过激光或者液氮手术。