眼皮部位出现扁平疣，要及时治疗，否则可能会对眼睛功能造成影响。扁平疣较其他皮肤病不同，其可突然消失，且没有任何疤痕组织残留，所以生长位置尚可，且没有任何异常情况，一般不用处理。
眼睛上长扁平疣是由病毒感染引起的，具有传染性，可通过如下方法改善去除：
1.眼皮上肉皮比较薄不建议做激光或者冷冻，可以用药物治疗。
2.可以外用他扎罗丁凝胶或阿达帕林凝胶在伤口上涂抹，或用0.5%的鬼臼毒素酊点涂于扁平疣的地方，而非正常皮肤。
3.可以服用病毒灵、异维A酸胶囊、牛羊肉、鱼虾等食物。
4..在日常生活中尽量不要搔抓，个人卫生用品要和别人分开使用，以防发生感染。
一般情况下，下眼皮长扁平疣可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善，具体内容如下：
下眼皮长扁疣，如果影响美观，并且出现瘙痒等情况，建议到医院皮肤科进行治疗，通过激光或冷冻等方式进行治疗。术后要注意日常的局部消毒，防止感染。平时要多吃一些清淡、容易消化、维生素含量高的食物，多吃一些新鲜的水果和蔬菜。不要吃辛辣刺激性的食物，也不要吃鱼、虾、海鲜、螃蟹等容易引起过敏的食物。
扁平疣可以通过口服药物进行调理。因为从口腔到五脏六腑的消化过程中，会有大量的药物流失，无法杀死病菌，因此，这种药物的作用并不是很好，而且需要数十日的时间，普通人根本无法承受。扁平疣可以通过激光切割。因为扁平疣是在皮肤表层，因此，雷射只能清除表层的扁平疣，而不是清除皮下的病毒，因此无法从根本上治愈，通常数个月后，它又会再次出现。
如果有扁平疣，可通过以下药物治疗：
1.可以服用重组人干扰素α-2b凝胶、咪喹莫特软膏等调整免疫力的药物；
2.还可以选择维A酸乳膏、他扎罗丁凝胶、阿达帕林凝胶等维甲酸类的药物。外用药渗透性、吸收性都比较差，而且皮损比较多；
3.可以通过激光、电灼等物理疗法来进行；
4.免疫功能低下的人容易得扁平疣，所以可以服用一些可以提高免疫力的药物，例如转移因子胶囊。