PV感染可以选择干扰素、抗HPV生物蛋白敷料以及红卡等药物来进行治疗。
HPV感染需要做TCT检查，有ASC-US或HPV16型感染、HPV18型感染、HPV18型感染、HPV连续阴性1年后需要做阴道活检。如果有宫颈病变，尤其是CINⅢ级及以上的患者，需要先进行宫颈病变的处理。
可以使用调整免疫力的药物进行治疗。
全身用药主要是针对病毒和调整免疫力的药物，常用的有匹多莫德、干扰素等，这是一种广谱的抗病毒药，具有一定的抑制病毒mRNA的能力，对大部分HPV感染者都有很好的治疗效果。HPV感染后要保持私处的卫生，同时要在医师的建议下进行正规的检查，不能乱用药物。
HPV用可用异维A酸、白介素、干扰素等药物治疗。
感染人乳头瘤病毒后需要进行治疗，可选择物理治疗、药物治疗、免疫疗法和手术治疗，常用的药物有异维A酸、白介素、干扰素、胸腺素、卡介苗、转移因子等，建议患者在医生指导下合理用药。此外，微波、激光、电灼、冷冻、光动力疗法等物理治疗可以去除肉眼可见的瘤体和亚临床感染。
目前没有治疗HPV感染的有效药物，但是可以通过角质剥脱剂、局部免疫调节药物等来缓解。
1.角质剥脱剂：主要用于治疗HPV感染引起的皮损，可以帮助皮肤上的细胞再生，促使角质层细胞脱落，从而缓解皮肤的不适。
2.局部免疫调节药物：干扰素凝胶、咪喹莫特乳膏等是临床上比较常见的局部免疫调节药物，这种药物能够诱导体内的细胞因子，从而达到间接的抗HPV感染的作用。
目前用于治疗HPV的主要有胸腺肽、转移因子等。
其中干扰素是一种广谱的抗菌药物。在不同的时期对病毒的影响。有许多不同的制剂。出现发热、过敏等副作用，怀孕和哺乳的妇女都不能使用。胸腺素是一种广泛的抗菌药物，对于生殖道疱疹、尖锐湿疣等疾病有一定的疗效。副作用包括心慌、反胃等。怀孕期间不宜使用，哺乳期间应暂停母乳喂养。
通常来说，“什么药物治疗hpv最有效”的说法不合理。HPV感染目前还没有特效药，可以通过口服干扰素等抗病毒药物进行治疗。干扰素是一种抗病毒、调节免疫、抗肿瘤的药物。干扰素具有抑制病毒、阻止病毒繁殖、杀死受病毒感染的细胞等作用。一般建议患者在医生的指导下使用。