没有“检查小肠最好的方法是什么”的说法，可以通过以下方式检查。
用胶囊式内窥器是口服进入胃和小肠的，利用胶囊内的电子成像装置对其进行扫描。是目前较为常用，安全，几乎无创的小肠疾病诊断手段。此外，肠镜也可以用于治疗小肠疾病，但其诊断程序比较繁琐，成本比较高。同时还要做小肠造影，在服用造影剂后，X线可以看到小肠的病变，从而对病情做出判断。
日常生活中，需要在居住条件拥挤的地方，做好环境卫生。尽量不要去不卫生的饭店吃饭。
进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
如果同房导致妊娠，可以在7-10天后用早孕试纸进行检测，也可以到医院采血检测HCG和孕酮，可以初步诊断妊娠。现在怀疑自己怀孕了，可以去药店买一个怀孕测试棒或早孕试纸来测试，以确定怀孕，月经推迟约10天前去医院做B超检查，以确定是否怀孕。
可以做彩超检查，配合做尿常规检查，如果出现了急性膀胱炎，可能会出现尿急尿频。并且需要防止膀胱炎，导致出现上行性感染，反复发热比较容易出现肾炎的情况。平时多注意休息。
小肠增强CT，是通过打造影剂之后，对小肠进行全方位的扫描，有时候可能需要结合重建，这样能够发现小肠的常见病，比如肠道炎症，肠道穿孔，肠道肿瘤，肠道畸形，肠道缺血。如果小肠CT检查，整个小肠显示正常，周围结构清晰，这样可以排除小肠病变，基本上小肠增强CT是小肠病变一种很好的检查方法，基本上可以发现源于小肠的所有病变以及对病变的性质，范围，邻近组织的侵犯等都有很好的显示。
