通常情况下，如果是单纯型霉菌性阴道炎，可以选择咪康唑栓剂、克霉唑栓剂、制霉菌素栓剂等栓剂，其中克霉唑栓、硝呋太尔制霉菌素栓剂是最有效的栓剂。如果是慢性真菌性阴道炎，单用阴道外用药物治疗，效果并不是很好，一般可以服用氟康唑，也可以是伊曲康唑。霉菌性阴道炎是反复发生的，要想完全治疗，首先要找到病因，排除病因。
对于患有霉菌性阴道炎的人来说，治疗霉菌性阴道炎主要采用有效的抗霉菌药物，局部用药，全身用药，同时可以采用改变阴道酸碱度，提高自身抗病能力，做好个人卫生等措施，一般是可以恢复的。治疗期间是要禁止性生活的。
怀孕霉菌性阴炎可以用碳酸氢钠溶液或者是红核妇洁洗液。霉菌性阴道炎是由白色念珠菌感染引起的阴道炎症性疾病，治疗霉菌性阴道炎需要使用抗真菌的药物治疗。怀孕后患霉菌性阴道炎，一般以阴道内局部放置药物治疗为主。怀孕的12周前，胎儿对外界影响比较敏感，尽量避免用药。孕3月以上，可以选择局部用药，且要选择妊娠期可用的药物，可以使用碳酸氢钠溶液或者是红核妇洁洗液等清洗外阴部位，缓解症状。
霉菌性阴炎一般是指外阴阴道假丝念珠菌病，小苏打一般是指碳酸氢钠，临床上常用剂型为片剂、注射剂。通常情况下，外阴阴道假丝念珠菌病患者遵医嘱用碳酸氢钠，有一定的治疗效果，能够一定程度上缓解瘙痒症状，但达不到治愈效果。患者遵医嘱使用碳酸氢钠，能够提高阴道碱度，抑制霉菌的生长，避免霉菌大量繁殖。但碳酸氢钠属碱性，过多使用可能会破坏阴道酸性环境，造成阴道内菌群失调，会对有益菌的生长造成破坏。所以一般不建议患者使用碳酸氢钠，可联系医生更改药物治疗方案，临床上一般使用克霉唑栓、制霉素阴道栓等药物治疗外阴阴道假丝念珠菌病。
真菌性阴道炎可以使用妇炎洁来清洗。
女性使用的方法是保持外阴的干净，而对于真菌性阴道炎，则需要使用一些抗真菌感染的药物，比如全身用药，局部用药。可以服用制霉菌素片，但制霉菌素片对消化道有一定的刺激性，可以用氟康唑进行阴道上药，可以用克霉唑栓进行阴道上药，持续用一星期，在此过程中要每日用妇炎洁清洁。在治疗后要做好白带常规的检查，以明确是否有感染。
霉菌性阴炎用药之后阴道会有大量的分泌物排出，主要是药物融化之后，混着原来的分泌物一起排出阴道之外。所以就建议患者要保持外阴局部清洁勤换卫生巾，每天用温热的清水或者是用5%的碳酸氢钠清洗外阴一次到两次。随着病情的好转分泌物会逐渐减少，临床症状也会逐渐消失。而霉菌性阴炎治愈标准是连续三次白带常规化验都是阴性，才可以停止用药进行治疗。