一般情况下，可以通过B超、MRI来判断肾结石的位置，具体内容如下：
如果患者体内有肾结石，患者应及时就诊，通过B超、MRI来明确肾结石的情况，以明确结石的位置，并对其大小、数量进行确定。在明确结石的情况后，患者可以对症进行治疗。如果肾结石的直径在0.6cm以下，患者可以通过多喝水、多运动、使用药物等方式来促进结石排出；如果结石的大小在0.6-2cm左右，患者可以选择进行体外碎石；如果结石较大，直径已超过2cm，患者则需要进行手术治疗。
通常来说，肾结石在哪个位置，需要视情况而定，具体分析如下：
肾结石的位置多在肾盂、肾盏、肾实质等部位，肾结石较少的话，可以直接进入输尿管、膀胱等部位。肾结石的预防要注意多运动，多排尿，促进尿液排泄，减少食用豆类制品和菠菜等食物，定期进行彩超，进行详细的检查，根据结石的大小来决定是否采用外科碎石或内科药物。
肾结石如果停留在肾脏内部，大多数不会有什么明显的临床症状，偶尔可能出现腰部钝痛和少许血尿的情况。如果结石脱离掉落到输尿管内，就会引起疼痛的情况。特别是输尿管有三个生理狭窄，如果结石嵌顿在这三个生理狭窄部位，会不容易脱离。长期嵌顿会形成输尿管积水或肾积水，疼痛的情况会明显加重，需要及时就医检查。
一般来说，肾结石会造成疼痛，是由于结石堵塞造成的，患者会有腰部的疼痛。
腰绞痛和腰胀痛都有可能是比较强烈的，要看结石的严重程度和阻塞的时间。如果是急性结石，会导致腰酸背痛。此外，还会出现恶心、呕吐、尿道刺激等情况。当然，如果结石堵塞的时间长了，就会导致肾脏积水，此时腰疼也会出现，不过疼痛一般都是比较轻微的，以腰部的胀痛为主，或者是酸胀痛。
肾结石疼痛的部位和结石的部位有关系。如果结石是在肾脏，是腰区疼痛，就是脊柱两侧腰痛。如果有小结石排到输尿管，可以出现腹痛，腹痛的性质比较剧烈，呈绞痛性质，可以伴有向会阴部放射。