糠秕孢子菌的毛囊炎与痤疮有如下不同之处：
1、发病部位：糠秕孢子菌毛囊炎多见于胸背皮层较多的部位，多见于免疫抑制病人，如激素病人；痤疮主要发生在面部、颈部，少数还会累及胸背部，这与人体的雄激素水平有关。
2、皮疹的形式，糠粉孢子菌毛囊炎是一种常见的毛囊炎症的圆形丘疹，除了这些皮疹，还有结节、囊肿、瘢痕、窦道、闭口粉刺等。
3、实验室检查：化验真菌化验中糠粉孢子菌呈阳性，痤疮为阴性。
糠秕孢子菌毛囊炎是由糠秕马拉色菌引起的毛囊性皮肤真菌病，病原菌是糠秕马拉色菌，是人体皮肤正常的一种菌群，寻常痤疮是一种多因素疾病，其发病与内分泌、细菌感染、皮肤角化异常、免疫反应等有关。
痤疮和毛囊炎的区别在于病因不同。
痤疮和毛囊炎都是发生在毛囊炎症性疾病。痤疮与毛囊炎不同，这是由不同的原因引起的，一般都是在油性的肌肤或者是在青少年时期出现的。毛囊炎一般可以出现在全身任何，而不只限于面部、胸背部、颈肩部等。所以痤疮与毛囊炎不同，两者有很大的不同。
不论是痤疮还是毛囊炎，都应及时就医治疗，防止病情加重。
糠秕孢子菌毛囊炎是由于马拉色菌感染毛囊引起的，一般发生在皮脂腺分泌旺盛的地方。可以用硫磺香皂洗澡，按摩15分钟左右再冲掉。外涂抗炎症的软膏，如果比较严重的情况下建议可以口服抗生素或处方药进行治疗。
毛囊炎由毛孔大量出油阻塞而导致发炎，或细菌，霉菌的感染而导致毛囊发炎来造成。导致皮囊炎的病原菌主要是金黄色葡萄球菌，痤疮是一种累及毛囊皮脂腺的慢性炎症性皮肤病容易发于面部、胸部、背部等皮脂腺分泌旺盛的部位，常伴有皮脂溢出，是多因素综合作用的结果，主要与皮脂产生增多，毛囊口上皮角化高进及毛囊内痤疮丙酸杆菌增殖有关。
糠秕孢子菌性毛囊炎和痤疮都属于毛囊炎症，区别在于糠秕孢子菌性毛囊炎属真菌感染，而痤疮属细菌感染.痤疮多表现为粉刺、丘疹、脓疱与囊肿，而糠秕孢子菌性毛囊炎多表现为散塞的毛囊性红色小丘疹和脓疱。