失眠的主要病因有以下几种：
一、心理因素。这是患者在晚上失眠的关键之一，一般心理障碍的情况，也会发生出现失眠，还有如果受到情绪的困扰或者心理压力大的时候也会出现失眠。在出现失眠后，患者还会表现出抑郁、焦虑等情绪，还会对健康过度的关心。通常患者对入睡时间估计过长，对睡眠时间又估计太短，这样又会给患者造成心理压力，使患者更加容易失眠。
二、环境因素。假如睡眠的环境的不同，例如吵闹的声音、灯光太亮、房间要拥挤等。
三、疾病与药物因素。假如病人有疼痛、频繁咳嗽、心悸等的疾病发生，那么，睡眠会受到影响。同时，病人服用中枢兴奋药物，或者长期服用镇静安眠药后突然停药，也有可能会出现失眠。
长期失眠的原因有很多，如心因性的因素，药物因素，身体因素：身体不适也会出现失眠的症状，如感冒等；精神疾病：焦虑症或抑郁症等精神疾病患者容易出现失眠；还有睡眠环境及地域变化也会引起失眠。
目前认为主要的“睡眠调节中枢”位於下丘脑腹前区，即视交叉上核，该区病变除导致睡眠-觉醒周期紊乱外，还可导致体温及进食活动的改变。医学上对睡眠的探讨，始於寻找“睡眠中枢”，位於下丘脑或第三脑室侧壁的病变能够产生持久的昏睡，但非生理性睡眠，亦不能解释醒-睡周期。
失眠的病因，一个是原发性失眠，另一个是继发性失眠。
原发性失眠多发生在年轻人身上，也就是没有准确原因的失眠。 很难找到失眠的准确原因。 多有遗传史和家族史，也可能与个人习惯和性格有关。 继发性失眠分为短期失眠和长期失眠。 短期失眠多与生活变化有关，表现在以下几个方面。 一是敏感人群在居住地发生变化时失眠。 二是严重的疾病和严重的环境因素，如搬到喧闹的环境中，进入非常恶劣的睡眠环境，受到强烈的刺激等，都会干扰患者的睡眠，强烈地影响失眠。
失眠的中医基本病机是阴阳失调、营卫不和、脑髓失养、心神不宁。
心、肝、胆、脾胃、肾等脏腑气血失调，阴阳失调，导致心火亢盛、肝郁、痰热、胃失平衡引起的心脏失养、焦虑。其位置在心脏，但与肝、胆、脾、胃、肾关系密切。失眠虚证多因心脾两虚、心胆两虚、阴虚火旺，导致精神失养；失眠是心火过盛，肝郁化滞，痰热内扰所致。但慢性失眠可表现为虚与实，或因血瘀所致。