一般情况下，孕妇怀孕时附件囊肿有以下治疗方法：
附件上的囊肿一般就是指的是卵巢囊肿。卵巢囊肿是一种良性病变，有些生理性的囊肿与激素水平有关系，会在月经后自行消失。有些囊肿不能自行消失反而会增大，这种情况一般需要手术处理，一般考虑是腹腔镜下手术挖除。
建议孕妇在孕期注意饮食均衡，多吃新鲜的水果和蔬菜，以此来补充怀孕期间所需要的各种元素，保证胎儿的健康。
卵巢附件区的囊肿，如果是在5厘米以内可以暂时观察，可以在2次月经干净以后再重新复查。因为很多卵巢囊肿是功能性的，也就是有可能是卵泡囊肿或者黄体囊肿，一般2个月以后就会消失。如果观察2个月，囊肿继续增大或者没有消失，就是卵巢肿瘤，需要做手术。一定不要做剧烈活动，因为卵巢囊肿容易出现扭转。一旦出现扭转，必须要急诊做手术，会出现剧烈的腹痛，时间长了会引起卵巢的坏死，影响卵巢的功能。
卵巢囊肿是指卵巢出现囊样的肿块。另外，应注意有时卵巢出现好像囊肿一样的改变，但并不是囊肿，如多囊卵巢、黄体囊肿、卵巢处的子宫内膜异位症等，这些疾病虽然也会在卵巢上出现肿块，但不同于卵巢囊肿。确定为卵巢囊肿，首先要确定是良性，还是恶性。
双侧附件同时患有囊肿确定为恶性的，要及时手术治疗。如果确定为良性病变，而且囊肿的直径小于5.0厘米，暂时不需要治疗，可以每隔3到6个月复查一次，如果囊肿的直径已经超过了五厘米，应该及时手术治疗。
通常情况下，附件囊肿患者不能吃辛辣、油炸、刺激性食物。具体情况分析如下：
附件囊肿指长在附件上的囊肿，而输卵管和卵巢统称附件。通常附件囊肿患者不能吃比较辛辣、油炸、刺激的食物，比如辣椒、川天椒、生姜、花椒、胡椒、茴香、八角、洋葱、肥肉等。附件区的囊肿分有生理的和病理的两种。比如黄体囊肿，在怀孕2-3个月后就会自行消失，不需要进行任何的治疗。炎症导致的滤泡囊肿可以在积极的抗炎处理后自行消失，但如果是比较大的囊肿并伴有腹部疼痛，则需要进行手术。
附部囊性包块可分为生理和病理两种类型。黄体囊肿是一种与怀孕相关的一种生理性囊肿，在怀孕后2~3个月内就会自行消失。输卵管积水、输卵管系膜囊肿、卵巢子宫内膜异位囊肿、卵巢畸胎瘤等都是病理原因。需要到医院进行彩超和肿瘤四项检查，以确定肿瘤的类型，然后再进行相应的治疗。
患者者要注意适量补充营养，尽量避免生冷、辛辣刺激性食物，如麻辣火锅、雪糕、酒等；应注意保持外阴清洁，注意保暖，避免着凉，以免引发感冒或其它疾病。