妊娠期有咖啡色分泌物多数是孕酮值太低或者是胎盘位置低造成的，主要就是卧床休息，只要量不多就不要紧的，平时的时候就多注意休息，必要时服用保胎药，如果一直出现这个，需要到医院做一个白带常规检查。
一般情况下，阴道咖啡色分泌物可能是环境影响、排卵期出血，或其他妇科疾造成的，具体内容如下：
在非月经期间，阴道内有咖啡色的分泌物，提示有出血的可能，由于出血量不大，在酸性和碱性的环境中会形成咖啡色或深棕色的分泌物。如果是在两次月经期间的中期，应考虑是不是在排卵期出现了，不需特别处理，一般只需坚持两三日即可痊愈，平时要做好个人卫生方面的护理。也有可能是患有子宫颈糜烂、妇科炎症等疾病，建议去医院进行妇科检查，并对症处理。
一般来说，月经过后有咖啡色分泌物，可能是妇科疾病引起的。
患者月经过后，阴道有咖啡色的分泌物，可能是妇科疾病引起的，如宫颈炎、阴道炎、盆腔炎等。患者可以到医院做B型超声波检查、阴道镜检查、白带检查。如果是内分泌失调导致，需要调经治疗；如果是子宫内膜感染导致的，可以选择口服抗生素及中成药进行治疗。注意治疗期间禁止性生活。
药流后干净了又有咖啡色分泌物，宫腔有残留物。成年女性的阴道呈酸性反应，因为少量的血在阴道酸性的作用下就变成咖啡色的，可以马上做清宫手术，清除宫腔残留物，同时要使用抗生素，防止感染。
怀孕流咖啡色分泌物一般是由于先兆流产或者是宫外孕所导致的，还需要及时到医院就诊。
如果在怀孕后发现有咖啡色的分泌物，通常可以及时到医院进行腹部B超检查，了解胚胎发育是否正常，没有异常通常不需要过于担心，如果是先兆流产所致，可以采取地屈孕酮片保胎治疗，如果是由于宫外孕所致，还需要及时的进行药物流产或者是手术流产。
在怀孕之前需要做好孕前检查，另外孕期还要按时孕检。
人流后第三天如果流出咖啡色的分泌物，这一般是由于在流产的过程当中，子宫内膜出现了感染造成的。
因为在手术当中，很可能会对局部造成一些损伤，从而会产生一些细菌感染的情况，这些病菌诱发子宫内膜炎症，就会形成咖啡色的分泌物。此外在手术的过程当中，如果对局部血管造成了损伤，也会导致一些正常的分泌物的，这种情况一般有五天左右能够缓解。