一般情况下，骨肽片有一定的副作用，常见的副作用有过敏、胃肠道不适、骨质增生等。但是由于患者的体质不同，部分患者可能表现比较明显，部分患者表现不明显。如果患者对多肽类组织过敏，服用骨肽片可能会出现过敏反应；部分患者在服用骨肽片初期，会出现胃肠道不适的情况，比如轻微的恶心、呕吐、腹泻等；骨肽片具有调节钙磷代谢的作用，可以促进骨的生长，但骨肽片吃得过多，很容易出现骨质增生的现象。
通常情况下，使用寡肽对皮肤没有明显副作用。
寡肽是一种合成肽，由多种氨基酸组合而成。当寡肽进入皮肤后，可以修复皮肤结构，促进细胞新陈代谢，起到收缩毛孔、淡化痘印、补水保湿的作用，一般没有副作用。但寡肽不能单独使用，大多数情况是与美容产品混合使用，从而避免挥发。
有些皮肤敏感的人用了寡肽后会出现过敏，出现发热、发痒等症状，此时可在医生的指导下口服西替利嗪片、氯雷他定片等药物。
胸腺肽主要作用于免疫系统，所以早期可能会有刺激免疫的一些副作用，比如发热，局部的疼痛，红肿。反复注射也有可能会引起过敏。这些副作用发生的可能性比较小，还是一个很安全的药物。
骨肽注射液主要是促进骨折愈合，按照常规剂量是不会有明显的副作用，当然任何药物都存在过敏的风险，如果使用过程中存在明显的不舒服，比如皮疹或者是心慌的，就需要尽快的停止药物的使用。
胸腺肽副作用发生的可能性比较小，还是很安全的药物。可以采取皮下注射，肌肉注射静脉滴注的方法，胸腺肽主要作用于免疫系统，早期会有刺激免疫的一些副作用，发热，局部的疼痛，红肿等情况。反复注射也有可能会引起过敏。
