男性生殖器上长小疙瘩可能是以下原因导致：
1.可能是平时不注重身体护理，出现珍珠疹导致的，此时不要过于担心,可以通过使用物理治疗的方法来缓解病情的。
2.也可能是毛囊炎引起，也可能是由于出现了尖锐湿疣等疾病导致的龟头部位有红色疙瘩,所以应该进行对症治疗。
3.有的患者如果出现了皮脂腺异位症，可能会导致局部有小疙瘩的产生，如果会有脂肪颗粒会引起阴茎根部出现了单个或者多个的疙瘩的产生。
男性平时应该有保持良好生活规律,如果出现了阴茎龟头上有疙瘩的症状，应该进行合理的治疗,平时多注意休息，不要过于劳累。
通常情况下，生殖器上长了个小痘痘可以通过日常护理、使用药物等方式进行治疗。具体分析如下：
1.日常护理：生殖器上长了个小痘痘，患者平时要注意个人的卫生，穿过的内裤要用开水烫，在太阳底下暴晒。平时清淡饮食，不要吃太过油腻的食物。
2.使用药物：生殖器上长了个小痘痘可能是尖锐湿疣引起的，患者可以在医生的指导下使用咪喹莫特乳膏、斑蝥素乳膏、鬼臼毒素软膏、氟尿嘧啶乳膏、重组人干扰素α2b注射液等药物进行治疗。
如果患者有异常的性生活接触史，要排除一下是否疣类。并根据结果对症处理，平时保持外阴干燥，注意个人卫生，多休息，饮食丰富，合理搭配，增加抵抗力。及时到医院的皮肤科就诊，建议常规检查，如果考虑为尖锐湿疣，建议局部微创治疗。
通常情况下，生殖器上有水泡，主要是因为生殖器疱疹，也有可能是因为带状疱疹侵犯了生殖器，或是水痘等病毒。但最常见的还是单纯疱疹病毒感染的生殖器疱疹，一般都是通过性接触传染的，局部的症状是成群性的水疱，并伴有轻微的瘙痒、灼痛。
如果患者是第一次感染，一般时间比较长，患者需要两个星期左右，然后病毒会潜伏在局部的神经节中，一旦身体的免疫力降低，单纯疱疹病毒就会再次激活，从而引起疱疹的复发。因此一般生殖器部位的疱疹是一种性病，很容易复发，而且很难治愈。
初期的艾滋病患者的生殖器官大概是没有什么变化的，到了晚期来可以看的出来，下身瘙痒，有红斑，全身疲劳无力，食欲减退，发热体重减轻，随着病情的加重症状日渐增多如皮粘膜出现白色念珠菌感染，单纯疱疹，带状疱疹，紫斑，血肿，血疱，滞血斑，皮肤容易损伤伤后出血。
问题分析：初步考虑为鲍温样丘疹病。需要进一步明确诊断，配合辅检。
指导建议：手术活检，配合创面清洁护理，外敷生长因子凝胶。
