单一治疗往往很难收到良好的效果，需要根据病情采取综合治疗。治疗上可以局部涂抹软膏，严重口服药物，可以配合中药治疗，饮食上少吃辛辣、油腻的食物，多吃蔬菜，保持面部卫生。容易上火的水果尽量少吃。
注意休息，避免劳累、外伤、受凉，端正身体姿势，避免长时间一个姿势，定时改变姿势，避免久坐、弯腰，避免负重，腰围固定，休息的时候拿下来，适当的进行腰背肌功能锻炼，三点支撑法，五点支撑法，燕子飞等等。
有可能属于痔疮脱出或者是直肠脱垂现象。痔疮脱出后在肛门口可以看到梅花瓣样的肉块儿，直肠脱垂属于套叠形状的黏膜突出。如果属于痔疮时，轻症可以保守治疗，严重时需要手术。
脱肛从中医来说属于中气不足，脏器下垂所致，治疗可以口服中药补气的药物。从西医来说属于提肛肌等固定直肠的一些肌肉功能下降。如果到了十分严重的地步，就需要进行手术治疗了。治疗期间不能蹲位排便，要立位、侧卧位或仰卧位排便，如能坚持1～2个月，有可能会治好。
可以服用抗生素抗感染治疗，然后局部涂抹乳膏，每次排便后用温水清洗肛门，保持肛周的局部清洁，但是如果肛瘘反复发作，瘘口比较多，形成了复杂性肛瘘，使用保守的治疗方法效果不好，要选择手术治疗，主要是手术切开引流。
