进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
一般查体包括基本检查：身高，体重，血压；内科心肺听诊，外科腹部，乳腺，甲状腺等诊查；骨科，五官科，泌尿科，肛肠科，妇科等专科检查；心电图；影像检查：胸片；超声：肝胆胰脾肾，甲状腺，乳腺，颈部血管等。尿便常规化验，血常规，肝肾功能，血脂血糖的化验，一般男性45岁以上，女性40岁以上查肿瘤标志物。其余检查可根据自身疾病情况及要求增加项目。
肝胆检查是肝胆脾胰肾彩超。经过肝胆脾胰肾的彩超检查，多可发现患者肝脏，或者胆囊内的疾病或者病变。如患者发现肝脏的占位性病变，需要进一步查上腹部的增强CT或者核磁检查，看患者肝脏占位的性质以及良恶性。
肝炎检查项目包括乙肝两对半、肝功能、HBV-DNA检测、B超等。两对半主要是检查是否是乙肝病毒的。肝功能异常再做甲肝，丙肝，戊肝等检测，确定属于哪种肝炎。确诊属于哪种肝炎后，对症治疗。
目前对于肝胆胰脾的综合性检查主要是包括血常规、病毒相关检查、肿瘤标志物、肝功能检查、肝胆胰脾影像学包括彩超、CT和磁共振。其中血常规、病毒相关检查、肿瘤标志物和肝功能检查需要通过抽取静脉血2-5ml进行进一步化验。而肝胆胰脾的影像学需要在空腹下进行检查。
