如果宫颈囊肿没有病原体的感染，没有接触性出血，就不需要治疗。是一个病变的生理过程，而导致的宫颈腺体管的一个堵塞。可以选择利普刀或者激光的物理治疗，应该定期做宫颈液基细胞筛查。
宫颈囊肿的中医治疗办法是药物治疗，包括内服外用等方式，同时会结合推拿，针灸等方式来进行治疗。因为很多患有宫颈囊肿的女性，还有一些妇科疾病，因此也会采用中药泡澡或者是中药剂冲洗下体的方式。
子宫宫颈囊肿要看是宫颈纳氏囊肿还是宫颈口囊肿，如果是宫颈纳氏囊肿，主要是宫颈炎的一种，可以一年查一次宫颈TCT，如果都正常，可以不要治疗，一年复查一次就可以了，如果是宫颈口囊肿就要做物理治疗切除，要确诊。
物理冶疗：认为是目前较好的治疗方法，适用于中、重度子宫颈糜烂。方法有电熨、冷冻、激光等。由医生根据糜烂程度和面积及身情况选用。创面愈合需4-8周，术后注意保持外阴清治，创面未愈合前禁性交、盆浴。
宫颈囊肿消失的办法是可以口服药物或者手术切除。患者有宫颈腺体囊肿时，具体的做法要依据患者的情况来定。例如患者的宫颈腺体囊肿非常小，没有任何的临床症状，只需要定期随诊即可。
中医治疗宫颈囊肿的效果并不好，中医认为宫颈囊肿主要是由于气血亏虚，湿热结聚所致，一般药物的效果并不好。中医治疗起效是比较缓慢，而且治疗时间也比较长，中医治疗能够缓解腹痛、阴道出血、白带增多等症状，虽然是可以通过时间控制宫颈囊肿，但是宫颈囊肿是因为炎症和细菌感染的，所以发病是比较快的。
