一旦确诊了甲减都要立即的治疗。一般选择口服药物进行治疗的情况比较多。开始的治疗的时间越早越好，甲状腺发育异常的病人，需要终生的治疗。药量要从小剂量开始，逐渐地增加。
甲减一般指甲状腺功能减退症。儿童甲状腺功能减低症的早期处理预后良好，推迟处理会发生不可逆性脑损伤的发生。
先天性甲状腺功能减退症儿童若出生后2周内即开始处理，多数儿童神经系统发育及智力水平均可恢复正常。如果发现不及时并着手进行正确对待，就可能造成孩子智力低下。但是是否能能够治愈，并不能完全明确，建议及时采取治疗。
亚临床甲状腺功能减退的原因有很多，亚临床甲减预后也不同。如果是慢性甲状腺炎引起的亚临床甲减，不能完全治愈，可能会逐渐发展成甲状腺功能减退，需要终身使用甲状腺激素替代治疗。如果是由于甲亢或者其他药物引起的亚临床甲减，那么很多亚临床甲减患者在排除其他原因后就能完全康复，但是这种情况比较少见。怀孕期间出现亚临床甲状腺功能减退的患者很多，要根据甲状腺相关抗体、甲状腺超声来判断是否能彻底治愈，需要在怀孕期间及怀孕后动态观察甲状腺功能变化。
在临床上，亚甲减通常不是可以完全治愈的。亚甲减是甲状腺功能减退的早期阶段，一般是指促甲状腺激素在5.6-10.0之间，但甲状腺激素正常。1/3左右亚甲减可改善，1/3的亚甲减可能发展为甲减，1/3的患者可能持续处于亚甲减的状态。只要不是血脂过高的患者，通常就可以服用左甲状腺素钠片，还需要进行动态的观察，以明确身体状况。
甲减是内分泌科的常见病以及多发病，是非常好治疗的。甲减一旦诊断明确，应该给予口服药物来进行治疗。还可以采用输液和给氧治疗，这样可以控制心力出现衰竭，也能够控制感染。
