一般情况下，甲状腺囊肿为甲状腺结节内良性病变，若甲状腺囊肿未对周围血管、气管造成压迫，且没有对颈部外观造成影响，则可不予手术，但需要定期复查以观察。
对于已经形成了较大肿块的患者来说，应该选择保守治疗方案，如果甲状腺囊肿影响颈部外观，或出现压迫周围脏器等症状，通常可考虑手术治疗，如在彩超指引下经皮甲状腺囊肿内穿刺、拔出甲状腺囊肿内液体等。
甲状腺囊肿不一定需要手术，其治疗方案取决于结节是否多发、结节大小、结节边界是否完整、钙化与否等来定。
甲状腺囊性结节大部分由甲状腺结节或腺瘤退行性改变引起。囊肿内亦有血液微混悬液，与周围边界清晰，质地坚硬，一般无压痛，核素扫描为冷结节，少数患者可由先天性甲状腺舌骨囊肿或第四鳃裂残余引起。结节大于1厘米，单发，结节边界不完整，结节内伴泥沙样钙化，须警惕甲状腺癌，可细针穿刺细胞学检查治疗，必要时外科手术治疗。
甲状腺囊肿一般大于3公分以上建议切除手术。
具体应该结合囊肿的性质和症状来决定。患甲状腺囊肿值得重视，首先经过彩色多普勒观察囊肿的具体情况。形态、血流无异常、体积不大、3厘米以内，检查甲功各项指标也在正常范围内，可先不切除，手术给予保守治疗，定期复查。经保守治疗仍不能得到有效控制时，囊肿生长速度快，出现吞咽障碍、呼吸困难、声嘶不适，并有恶变迹象时，应及时行手术切除，避免严重后果。
一般来说，甲状腺囊肿能治好。
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。一般情况下，甲状腺囊肿属于良性病变，通常能治好。如果囊肿肿大不影响到颈部外观，或者压迫其他的器官和喉返神经，观察即可；如果特别大，影响美观，或造成身体不适，可以进行囊肿摘除术。
患者在日常生活中应当加强身体锻炼，注意保暖，饮食清淡，不吃刺激性食物多，吃富含钙质的食物，不要吃刺激和油腻的食物。
大多数甲状腺囊肿属于良性结节，一般随诊观察即可，但也有部分甲状腺囊肿需手术治疗，具体如下：若结节较大，影响美观或囊肿有破裂可能，可考虑做甲状腺穿刺，抽取囊液，并打硬化剂，以免结节进一步长大或复发，此类方式有一定复发率；若心理紧张，且担心恶性可能，也可考虑手术治疗。
甲状腺囊肿属于良性疾病，当囊肿较小时，对人体的身体健康没有影响，一般不需要特殊治疗，定期进行甲状腺彩超，甲状腺功能检查等随访。如果囊肿持续增大，出现压迫症状，或者疑有癌变，应择期慎重考虑手术治疗，术后长期以甲状腺激素替代。
