灰指甲根据临床的类型，白色浅表型的和远端侧位甲下型，采取外用药物治疗，近端甲下型、全甲毁损型的甲板、指甲根有损害并且损害的数量超过四个以上，就采取内用药物治疗，有的情况严重但不适用内用药治疗，可以采用外用药物治疗。
要去除灰指甲，需要使用抗真菌的药物来治疗，临床上在医生的指导下，使用抗真菌的药膏局部涂抹治疗，也可以同时配合口服抗真菌药物治疗，在使用药膏局部治疗时需要使用刀片或者指甲锉把指甲刮薄在涂抹药物。
治疗灰指甲要根据病情严重程度不同而采取不同的治疗方案。对于受累指甲比较少、病变比较轻的情况，可以外用药物治疗，涂药时需要先用指甲剪，将破损的指甲剪掉，用指甲剪上的锉刀将指甲表面磨得毛糙，以有利于药物吸收，需要用药2-3个月左右才能有明显疗效。
有灰指甲疾病是由于感染真菌所造成的，真菌感染会导致指甲颜色变白，变灰色，指甲变厚等表现，灰指甲比较顽固的，但是目前的医疗技术对灰指甲还是可以治疗好的，可以选择使用抗真菌的药物治疗。
可能是由于真菌感染，不注意卫生引起的灰指甲，有可能是有灰褐色，或者是由于黄色的斑点导致的。建议可以外用专业药物，不要吃辛辣食物，刺激性食物，平时一定要多注意卫生的。