一般情况下，婴儿黄疸照蓝光的危害主要是引起不良反应、引起皮疹、皮肤变色等。
婴儿的黄疸主要表现为非合并的胆红素升高，可以进行蓝光照射，但仍有一些不良反应，可能会出现发热、腹泻等症状，但不会很严重，可以继续通过光疗进行治疗，同时要注意补充水分；部分婴儿可能会有皮肤上的红疹，一般光疗就会自动消失。婴儿肺结核胆红素超过4mg/dl，同时血清中的谷丙转氨酶和碱性磷酸酶升高，照射蓝色会导致肤色变成铜绿色。
新生儿黄疸照蓝光有副作用，但是副作用多不严重，是很轻微的，不影响继续照蓝光。蓝光照射的副作用可以有发烧、腹泻和皮疹，因为蓝光可以分解体内的核黄素，如果蓝光照射时间超过24小时，可以引起核黄素的缺乏，所以光疗的时候要补充核黄素。
蓝光治疗新生儿黄疸是有副作用的，主要是对皮肤的危害较大，容易引起发热、皮肤灼伤、皮肤脱水、钙缺乏和维生素B2的缺乏。所以在治疗的过程中一定注意保护皮肤，适量添加钙剂和维生素B2，多补充体液。
蓝光疗法具有低的不良反应，是比较安全的。蓝光疗法有：低烧、皮疹、腹泻、核黄素不足等不良反应。会造成不明显的水分流失，在照射时要多饮水。没有蓝光照射后，疹子就会消失。
腹泻是由于胆红素在肠道中的排出，从而促进了肠道的蠕动，从而导致了大便的频率升高。在进行蓝光治疗时，会损伤到体内的核黄素，需要给予一定的剂量。
黄疸蓝光原理是利用皮肤能够吸收波段在450纳米到550纳米之间蓝光，促进黄疸的代谢有助于黄疸的恢复。黄疸主要是病理性黄疸与生理性黄疸，生理性黄疸平时多晒太阳，可以缓解。是属于正常现象，不要担心。
蓝光是降低黄疸的一种比较简便有效的方法，在光的作用下非结合胆红素就转变为水溶性胆红素，水溶性胆红素增多，这种水溶性胆红素就可以经过尿液和胆汁从体内排出，所以黄疸就下降了。
