碘131放射线治疗甲状腺功能亢进是会造成甲状腺细胞不可逆的损害，用量大，会造成甲状腺功能减退，终身用药补充。用碘131治疗甲亢后对人体的生育能力有一定的影响，会出现不孕症、流产率、畸胎和遗传异常等情况较高发于一般人群。
治疗之后可能出现放射性甲状腺炎，患者通常表现为甲状腺部位疼痛，也有可能会有体温升高，进一步疼痛加重等。永久性甲状腺功能减退，射线进入体内以后，随着时间延长会有效果递增作用，也就是时间越长，发生甲状腺功能减退症的概率就会越大。
甲亢是一种慢性代谢性疾病，有口服抗甲状腺药物。碘-131是对甲亢很有效方法，好处在于碘-131治疗甲亢方法简单，周期短。弊处在于碘-131剂量过大容易造成甲状腺功能减退，个别患者可能发生放射性甲状腺炎，甚至诱发甲亢危象。
甲状腺内储存的激素足够维持1-2个月，所以碘131治疗后短期内，甲状腺内储存的激素释放入血，出现甲亢症状的加重，随着储存激素的耗尽，甲亢症状逐渐好转。碘131治疗甲亢见效的时间大概1月。半年后，如甲亢没有治好，可以再次行碘131治疗。
碘131，属于一种放射性核素，治疗甲亢主要就是破坏甲状腺滤泡，使甲状腺一过性释放增加，破坏甲状腺激素合成和分泌的场所，那么约50%的患者治疗后会出现甲减，需要终身口服药物。
近期内可以出现一过性甲减、一过性甲亢或者甲亢复发、放射性甲状腺炎、疼痛等症状，通常都能自行缓解和恢复。远期除永久性甲减外，还有可能对比邻组织如甲状旁腺等造成影响，但较为少见。
