输精管堵塞，首先可能会造成男性的不育，因为精子不能通过输精管排出。另外，会造成睾丸的萎缩，还有就是会引起并发症，比如睾丸缩小等。另外，还会对病人的心理造成很大的阴影。
要根据病的程度来判断治疗的时间。输精管堵塞不是一个独立的病，而是多种病造成的一种症状。进行正确的治疗，坚持治疗，减少吃那些辛辣，刺激的食物。多吃一些清淡的。
得了轻微输精管堵塞，如果没有生育要求，可以不用医治。但是如果有生育要求，甚至在备孕期间，是需要及时医治的，轻微输精管堵塞会导致不育，因为男性的精子不能通过输精管被排出，而是停留在了输精管堵塞的部位，就会使得精子不可能和卵子相遇形成受精卵了，而没有受精卵就更别提生育了。
一般不育病人检查精液发现无精子症，就需要做抽血检查、α糖苷酶以及甘油果糖，这是一个大致判断的标准，如果提示增高，有可能就是输精管堵塞。确诊需要在切开的基础上做一下龙胆紫试验，可以观察是否通畅，如果不通畅可以直接手术治疗。
治疗输精管堵塞首先要看以前是否做过结扎，或是以前是否有炎症而引起了梗阻，另外还要看梗阻的部位和长度。如果是结扎引起的，那么手术部位就比较明确，可以做显微手术进行疏通。如果是结核引起的，那么手术可能无法达到要求，可以对睾丸附睾进行穿刺取精，进行辅助生育。
输精管的堵塞一般就是采用手术治疗，其中的输精管吻合术对治疗输精管堵塞的效果更好，也可以通过显微镜手术，找到梗阻的部位，将梗阻部位切除以后，疏通缝合，能够达到疏通的作用。