卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
卵巢囊肿的大小，可以通过自己躺在床上，平躺着然后按压小肚子两侧卵巢的位置，看看是否能够摸到肿块，这也是检查的办法之一，不过这种检查不是很准确。检查方式还是通过B超检查，能够测出囊肿的大小，也能预估生长的速度，判断也更为准确。
卵巢囊肿手术的指征一般是五厘米以上，就需要进行手术切除了，而且卵巢囊肿的可以发展到十公分以上。对于卵巢囊肿的治疗，如果体积比较大，服用药物是不能够治疗的，只能够控制卵巢囊肿的生长。需注意复查b超，每3-6个月复查一次，以监测囊肿变化情况。另外要避免进食激素含量丰富食物。
卵巢囊肿在年轻的育龄期女性中发病率很高，患者一般也没有明显的症状。如果是比较大的卵巢囊肿，患者可能会在下腹部摸到一个包块。一般情况下，卵巢囊肿的诊断主要依靠B超、盆腔C等检查，这些检查不仅可以发现囊肿，还可以判断囊肿的性质是生理性或者病理性，对医生根据患者的身体情况以及病情，制成合适的治疗方案有一定的帮助。
卵巢囊肿是由炎症或巧克力囊肿引起的。卵巢囊肿是由炎症引起的，可以通过抗炎药物、中药和西药的联合治疗而完全治。治率很高。卵巢囊肿是巧克力囊肿，应通过手术治疗。然后每天热敷腹部。可以再次检查超声波，看看囊肿是否缩小。囊肿缩小，你必须考虑手术治疗。
