一般卵巢囊肿这种疾病是不会影响排卵的。具体情况分析如下：
卵巢囊肿主要是长期慢性炎症刺激，导致卵巢的腺管堵塞之后，不能很好的分泌液体，从而形成的一种肿块。大部分卵巢囊肿都是良性病变，因此对患者的内分泌影响不大，不会使得患者出现排卵减少，或者是不排卵的情况，但是卵巢囊肿可能会压迫到局部的肌肉组织，引起腹部疼痛，所以建议患者及时治疗。
卵巢囊肿的类型和卵巢囊肿是否会自行消失有一定的关系。女性在月经来潮后会出现生理性黄体囊肿。巧克力囊肿、畸胎瘤、恶性卵巢囊肿等是病理性的卵巢囊肿。巧克力囊肿、畸胎瘤超过5cm应尽早手术。卵巢囊肿是恶性的，也要做好术后的病理检查。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
目前还没有专门的理论来解释卵巢囊肿的原因，但一般和遗传因素以及个体因素有关。
1、遗传因素：女性或外祖母患有卵巢囊肿的后代更容易得卵巢囊肿；
2、个体因素：正常发育时出现的良性囊性肿瘤，比如卵巢畸胎瘤。所有的患者都有不同的原因。
女性在做卵巢囊肿的时候，可以主观的触摸到附件区囊性肿物或者是包块。通过B超、彩超等检查，可以明确腹前区是否有囊性肿块，具体的可以通过磁共振和CT检查来明确。
巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
常表现为月经失调，像月经过少、月经稀发或者闭经，毛发重，肥胖等。排卵是一个正常的生理过程，正常生育年龄的妇女每月都有一次排卵，排卵的时间通常在下次来月经前的两周左右。
如果由于炎症引起的卵巢囊肿，再抗炎治疗，以后大部分都会消下去的，就是如何判断这个卵巢囊肿，很难判断，所以说，如果有卵巢囊肿，在月经干净3到5天做b超，如果有，并且持续三个月，卵巢囊肿直径大于三公分，可以手术治疗。
