早上醒来腰两侧疼可能是以下原因引起的：
腰两侧疼痛的病因有很多，第一要注意疼的部位和腰背部是否有敲击痛，同时还存在肾脏部位的敲击痛，这是因为结石导致的，所以要做泌尿系统的超声波检测。没有肾结石的患者，腰间的压迫感很有可能是腰肌劳损，还要看有没有腰椎扭伤的历史，还有就是床垫的柔软度，如果床垫过柔软，会引起腰椎的过度弯曲和肌肉的劳损。
选择药物离子导入治疗：是运用中药在肾腧穴以超声离子导入方式，借助局部穴位刺激、药物渗透，从而达到提高肾脏血流、减少蛋白尿、血尿和改善肾脏功能等效果。云火活肾疗法：激活肾单位，使肾脏增长至正常。
蛋白尿是可以治好的，如果是急性肾炎合并的蛋白尿，或者尿路感染也会合并蛋白尿，这两个原因导致的是可以完全治好的。如果是慢性肾炎或者肾病综合症，治疗起来可能相对难度大一些。如果对激素敏感，可能用激素或者免疫制剂以后，蛋白尿会完全消失，有的或许需要长期的服药或者需要继续治疗才可以得到好转。
考虑可能是因为晚上经常受凉以后导致有一些寒邪阻滞经络，同时可能是一些腰肌劳损为主，可以到医院进一步检查。治疗上可以适当外用一些通经络的药膏，具体用药请遵医嘱。也可以选择做一下中药熏蒸等治疗。
早上醒来胃疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
首先，可能是因为十二指肠的炎症和溃疡，导致了上腹部饥饿的症状。这种疼痛是有规律的，一般是在两顿饭之间，直到下一顿饭吃完之后，才会减轻，或者是晚上睡觉之前会疼，或者是睡觉之后会疼醒，或者是在吃了一些碱性的药之后，会感觉到疼痛。临床上会出现钝痛、灼痛、胀痛、饥饿样不适等症状。
