一般情况下，肾结石的治疗可根据结石大小，选用药物或体外冲击波碎石及手术等方式进行治疗。具体分析如下：
1.直径6毫米以内的肾结石：患者可在专业医师建议下，遵医嘱，口服排石颗粒，多饮水勤排尿，通过跳绳等运动来促进结石排出体外。
2.直径6毫米以上2厘米以内的肾结石：此类患者建议通过行体外冲击波碎石等方式进行治疗。
3.2cm以上，或质地较硬的肾结石：可以选用经皮肾镜碎石取石手术进行治疗。
膀胱结石外科治疗的方法包括内腔镜手术、开放性手术和体外碎石术。内腔镜的治疗：经尿道膀胱镜结石的治疗方法是目前治疗膀胱结石主要的方法。方法的优点，它可以直观、直接的碎石；可以同时处理下尿路的梗阻性疾病，比如说尿道狭窄、前列腺增生。目前使用较多的是钬激光碎石术：一个是可以治疗结石；第二个可以治疗引起结石的其他的疾病，如尿道的狭窄、前列腺增生等情况。
对于肾结石，仍需结合具体患者情况具体分析。由于不同患者其肾结石大肾结石小肾结石位置及肾结石梗阻轻重均有差异，治疗方法各异。
当较小肾结石未形成梗阻或梗阻较轻时，也许最为有效的手段是保守治疗，而采用体外震波碎石加排石药物也许最为有效。如果结石梗阻较严重，或结石体积较大的话，此时也许最为有效的办法就是用手术治疗了，手术当然以微创手术为主，把结石从身体里拿出来，才能达到更好的疗效。
当换了尿结石之后，是可以采用体外碎石法，然后进行药物辅助排石的，也可以进行手术治疗，可以通过输尿管镜，输尿管软镜等方法进行体内击碎的方法，但使用药物排出，效果不是太好，要注意自己的饮食习惯。
肾结石的治疗要根据结石的大小、位置来选择。对于6mm以下结石可以尝试口服排石药物；6mm到10mm的结石可以选择体外冲击波碎石治疗；10mm到20mm的结石可以选择输尿管软镜钬激光碎石治疗；20mm以上的结石软镜碎石效率太低，目前主要推荐经皮肾镜钬激光碎石，对于部分复杂的完全鹿角型结石也可以选择肾切开或肾盂切开取石，但是相应的手术创伤会明显增加。
中医治疗胆结石的方法主要是口服中药进行治疗，这些药物都具有一定的抗炎作用，同时可以利胆排石，有利于胆汁疏泄，调节肝经，可以改善胆囊炎、胆结石等相关的症状，比如后背疼痛、口苦、咽干，甚至出现腹痛、发热等。
