确诊后宜立即手术，因流出的囊液可引起盆腔粘连、不育或异位内膜的再次播散和种植。年轻未生育者在吸引和彻底冲洗吸引溢入盆腔内的囊液后，做囊肿剥出术，尽量保存正常卵巢组织，对维持卵巢功能和内分泌功能有助，对日后增加孕育机会也有助。
及时去正规的医院做进一步的检查，然后根据检查结果，尽快选择合理的方法手术治疗。如果病情发现的比较早，治疗的比较及时，相信病情也是可以缓解的，在治疗过程当中，病人一定要把心情放松，思想上不要有什么压力。
治疗巧克力囊肿如果采用药物治疗效果不好，如果是有生育要求的病人，一般采取腹腔镜手术治疗，在腹腔镜手术的时候需要保留卵巢的功能，并不能完全切除。对于生育没有要求的女性，采取腹腔镜手术室进行治疗，巧克力囊肿完全的摘除而不是剥离。
一个是西医手术治疗，另一个是中医保守治疗。因此病为代谢性质的疾病，手术无法彻底治，即使手术，年龄小，复发的几率也特别大，此病由内分泌紊乱所致，治疗方法就是中医保守治疗。
右附件囊肿有生理性的和病理性的两种，前者主要见于黄体囊肿和滤泡囊肿，黄体囊肿是在月经期后半期出现，而滤泡囊肿则多是在月经期的前半期出现，待月经干净后多会自然消失，不会对身体造成不良影响；病理性卵巢囊肿是因卵巢的上皮细胞异常增生而形成，需要在医师的指导下决定是否需要药物或手术治疗，或只需要定期复查就可以。
卵巢巧克力囊肿是一种疾病，具体分析如下：
卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位在卵巢深处，经血无法及时排出，从而滞留在卵巢中，形成了一个囊肿，这种囊肿一般都是巧克力糊状，也就是所谓的卵巢巧克力囊肿。卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位所致，会出现痛经、月经紊乱等情况，甚至会出现不孕的情况。卵巢巧克力囊肿的治疗方法有两种，一是保守治疗，二是手术，如果病情不是特别严重，可以口服激素类药物。
