有副作用，主要表现在导致尿量减少，最终无尿，容量负荷过重，还会出现透析低血压、高血压、透析器过敏、失衡综合征、腕管综合征、空气栓塞、出凝血功能障碍以及血小板减少等副作用。
晚期尿毒症可以出现急性心衰，严重高钾血症，消化道出血，中枢神经系统障碍等严重的症状。尿毒症晚期需要采取肾脏替代治疗，包括血液净化和肾移植，前者常用有血液透析，腹膜透析和血液滤过等。
尿毒症不是传染病。尿毒症也就是慢性肾衰竭的终末期，是各种肾脏疾病逐渐导致肾功能渐进性不可逆的减退，直至肾功能逐渐丧失，而出现的一系列临床综合征。尿毒症不是一个独立的疾病，而是各种晚期的肾脏病共有的临床综合征，是慢性肾功能衰竭进入终末阶段时出现的一系列临床表现所组成的综合征。
尿毒症血液透析的病人存活时间与年龄、原发病及营养状况关系密切，同时和血压控制的好坏、并发症的控制、贫血程度以及钙磷代谢是否纠正有关。例如日本有一例维持性血液透析可达到40年之久，在我院亦存在透析存活近20年的情况。所以透析需根据出现的症状对症治疗，每月及时化验、控制血压、治疗血糖等，延缓并发症的发生，来延长生存期限。
尿毒症血液透析一身疼是因为钙磷代谢失调所致，出现低钙和骨质疏松的症状。另外也有肾衰竭的因素，可以通过补钙治疗，同时补充维生素效果还是比较好的，疼痛严重者，还可以配合镇静剂，镇痛剂。
