支原体感染和衣原体感染一般都是同时进行的，这两种没有严重之分，因为严重性都是一样的。支原体和衣原体感染属于非淋，也就是一种性病，这种病具有传染性，在治疗期间要多注意卫生，经常清洗感染部位，而且尽量在这一段时间不要有性行为。
支原体衣原体感染引起的疾病叫非淋菌性尿道炎，需要使用抗生素进行治疗，用药之前需要进行皮试，到正规性的医院接受诊治。因为具有传染性，治疗期间禁止同房，同时要避免跟家人间接接触感染。
支原体和衣原体的感染不自愈。
支原体、衣原体是病原体之一，它是细菌和病毒中间的一种病原体。主要侵害人体气管黏膜，生殖器，皮肤和黏膜。当存在支原体，衣原体的感染，人体的临床表现并不一定存在，有的还是体检时发现的，需要及时治疗。
如未得到及时处理或规范处理，支原体在身体的某一个部位总是存在的，当机体抵抗力降低时，可导致临床症状出现。
如果机体受到支原体感染引发咳嗽症状，关键是要采取抗感染治疗。首选药物为阿奇霉素、罗红霉素等大环内酯类抗生素。
大环内酯类抗生素有红霉素片、乙酰螺旋霉素片、阿奇霉素片、罗红霉素片、克拉霉素片等，是临床上比较常见的抗菌药物，对革兰阳性球菌和阴性球菌、厌氧菌、军团菌、支原体等病原体均有一定的抗菌效果。
肺炎支原体衣原体可以使用抗生素。
如肺炎衣原体感染，可使用大环内酯类抗生素，例如罗红霉素和阿奇霉素，也可给予四环素类抗生素，如米诺环素。另外，还要注意患者是否合并其他疾病，例如糖尿病，同时需对症处理，如有热等情况，然后服布洛芬。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用，以免用药不当，损害身体。
女性支原体、衣原体可以通过药物进行治疗。
妇科支原体、衣原体感染一般都是用一定量的抗生素进行治疗，一般情况下可以将其分离出来，然后进行药物敏感性测试，以确定哪些抗生素比较敏感，然后进行相应的治疗。常用的抗生素有红霉素、阿奇霉素等。对于支原体、衣原体等，一般不能使用其他的广谱抗生素。
