因为漱口水只是在口腔局部起作用，经口腔粘膜吸收很少或几乎没有，不口服下去，就不会经过消化道吸收，因此在孕初期是可以使用的，但注意不要吞服。注意一定不要熬夜，上火。
孕妇在怀孕期间，由于体内激素水平的升高，往往60%以上的孕妇会出现牙龈的水肿，感染牙龈炎，牙周炎的机会相对增多。在刷牙的时候往往会出现出血的现象，所以这种孕妇往往选择漱口水，所以孕妇是可以用漱口水的。但是要孕妇使用好的漱口水，也可以到口腔门诊去购买专业的漱口水。
一般情况下，龋齿痛可以用氯己定漱口水。但是用漱口水并不能治疗牙疼，漱口水只能辅助保持口腔卫生。龋齿痛的原因可能有很多，包括龋齿、牙髓炎、根尖周炎等。
建议患者及时到医院完善相关检查，明确病因后进行对症治疗，改善不适。同时建议患者在平时要保持口腔部位的清洁卫生，饭后漱口。平时也要少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
会造成口干，灼热，长期使用治疗性漱口水容易使牙齿及口腔黏膜表面着色，使味蕾的味觉降低，并抑制唾液的分泌，造成口干，灼痛等不适症状。因此药物性漱口水需要在指导下有选择地使用，不能自行长期使用。
不能天天用，漱口水分为清洁类型以及治疗类型两种制剂，起到治疗效果的漱口水中含有大量的消炎成分，长期使用会导致口腔中的菌群失调引发牙龈炎或者牙周炎等口腔疾病。
用漱口水后仍需刷牙，漱口不能代替刷牙，只能作为口腔护理的辅助用品，无法彻底清除牙面上的菌斑及细小缝隙中残留的食物，不能完全发挥预防龋病的作用。治疗型和保健型漱口水使用前最好向医生咨询，抗菌成分的漱口水不适宜长期使用，容易引起口腔菌群的失调，引发一系列的口腔黏膜疾病。每天早晚2次刷牙非常必要。
