宫颈囊肿的多数无临床症状，在查体时偶然发现，不需特殊治疗。如果腺体囊肿较大，伴有白带增多等不适需及时治疗。一般治疗无症状可以观察，定期宫颈刮片（TCT）；或者用针刺破，涂以碘伏。
采用腹腔镜手术治疗方法，腹腔镜创伤很小，瘢痕小，粘连的机会变小。这种手术对周围组织的损伤降至最低。对于散在的比较小的宫颈腺囊肿一般不需治疗，只要每年检查即可。对于密集的较小的纳氏囊肿或比较大的囊肿，可考虑光疗、激光、微波、自凝刀等物理治疗。注意多休息，不要吃辛辣刺激的食物。般没有临床症状，是不需要治疗的。
宫颈的上皮细胞，随着体内的雌激素水平的高低会出现变化，宫颈纳氏囊肿不会影响怀孕。如果宫颈囊肿比较大或多发，或引起白带异常的症状，需要进行治疗。可以做微波、利普刀、冷冻、激光等物理治疗，在月经干净后三到七天可以做治疗，治疗以后一个月内不要性生活，治疗后要注意复查。
宫颈囊肿用艾灸治疗，没有什么效果的。宫颈囊肿是属于慢性宫颈炎的一种，如果没有白带的异常囊肿比较小，不需要治疗，可以每一年复查一次，平时不要穿紧身化纤内裤，多穿宽松棉质内裤，保持阴道的通风干燥。
宫颈囊肿通常不需要进行特殊处理，但若宫颈囊肿或过大或囊肿数量过多，可以切开引流。也可局部用清热解毒类妇科洗剂冲洗宫颈，宫颈囊肿是子宫颈腺体发生的囊肿，大多数情况下是子宫颈的生理性改变，子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺口或深入腺管将腺管口阻塞，导致腺体分泌物引流受阻，潴留形成囊肿，子宫颈局部损伤或子宫颈慢性炎症使腺管口狭窄也可导致子宫颈腺囊肿形成。
