乙肝大三阳通过科学、规范的抗病毒治疗，少数患者可获得临床治疗。治疗目标包括乙肝病毒转阴、肝功能恢复正常、大三阳转变成小三阳。抗病毒药物包括干扰素类和核苷（酸）类似物，干扰素包括国产干扰素和长效干扰素。
大三阳治好后乙肝两对半会有转阴的表现。乙肝病毒携带者有大三阳小三阳，以及单纯表面抗原阳性等多种存在形式，需要结合肝功状况，病毒数量多少，确定是否用药治疗大三阳如果肝功异常，病毒数量多，就需要使用抗乙肝病毒药物。
乙肝治疗有难度，但是如果选对正规的肝病医院，采用正确有效的治疗方法，再结合科学的日常调理，肝病康复还是有希望的。在治疗的时候要选择正规的医院，同时要选择科学规范的治疗方法，避免治疗误区，传统的乙肝治疗方法只能抑制病毒的复制，并不能有效的清除肝细胞核心内部的病毒。而最新技术治疗的诞生给很多带来了康复的希望，可以进一步了解。
查出大三阳后还需查肝功能、乙肝DNA以及肝、胆、脾门静脉彩超，了解肝功能是否正常，病毒复制的高低，彩超有没有提示肝硬化。大三阳病人一般病毒复制比较高，传染性强。当肝功能正常时，机体处于免疫耐受期，不是治疗的较好时机，但需定期复查。当转氨酶升高到正常值两倍以上时，机体处于免疫清除期，可以行抗病毒治疗。
只要是正规治疗，大三阳转小三阳的几率还是很大的，需要进行抗病毒治疗，不要饮酒，不要过度劳累，要定期复查肝功能和病毒载量，必要时使用保肝降酶药物治疗，还要定期复查AFP和腹部彩超，以免出现癌变的情况。
