患有肛窦炎可以先保守治疗，严重时手术治疗。每天用生理盐水清洗肛门，温水坐浴，注意饮食，多喝水，多吃蔬菜水果，饭后适当的运动，保持大便通畅，防止便秘。忌烟忌酒作息规律保证充足的睡眠。
孩子患了肛窦炎，首先是要注意个人卫生，每次孩子大便后应该要用温热水，将肛门部位擦洗干净，并且外用消毒液消毒，需要的时候可以口服抗炎药物进行治疗。严重时要输液来治疗。
单纯性肛窦炎可以药物治疗，如果效果不明显需要进行手术处理。采取侧卧位或截石位，进行常规消毒和局部麻醉，暴露患病的肛窦，沿探头切开肛窦，修剪伤口以保证引流通畅。术后每天进行中药坐浴，换药至病人康复。调整饮食，不吃辛辣生冷刺激性食物，不要坐在冰冷潮湿，注意个人卫生。
细菌侵入之后就会引起肛窦内感染并沿着肛门腺导管和肛门腺蔓延所以肛窦炎又是引起多种肛门直肠病的根源如肛门直肠周围脓肿、肛瘘、肛裂、痔疮、肛乳头炎等肛管上皮癌的发生也与慢性肛窦炎症的刺激有关饮食以清淡、易消化为主多饮水忌食辛辣、燥热、发物和酒类并保持大便通畅养成良好的生活习惯。
平常注意调理，在配合药物治疗的，一般是可以恢复的，坚持做提肛运动。建议还是少吃辛辣食物，戒烟戒酒，平常多喝水的，再配合喝点蜂蜜水，多吃香蕉。多吃富含维生素的蔬菜和水果，再配合用一比五千的溶液清洗肛门，热毛巾热敷。
需要及时的进行药物或手术治疗的，肛窦炎属于炎症感染的情况，是由于细菌感染所造成的，需要使用抗生素治疗。可以到医院的肛肠科，协助检查，明确诊断，再对症治疗。平时注意饮食清淡。
