补牙的过程并不疼，先把所有龋坏组织细菌彻底清除，然后在对牙洞进行充填，如果牙痛比较深，比较接近牙髓组织，会在牙洞里首先垫一层氢氧化钙类物质，最后对充填的表面进行调磨。
补牙疼痛分很多种情况，如果浅的牙齿越早补疼痛就越少，牙齿龋坏严重在处理过程中会有酸的感觉，也不会痛，补牙把牙齿里面磨平不会碰到肉和神经，所以不会痛，对于补牙如果有疼痛，可以麻醉来进行牙齿充填的，据个人承受能力和牙齿龋坏严重程度而定。
补牙洞的时候有可能会疼。第一主要根据洞的深浅，是否近髓或者是否露髓有关。第二是洞的位置有一定的关系。1.如果洞的位置较浅，补牙的过程中及术后基本不会出现疼痛。
补牙之后牙齿出现疼痛，需要具体分析。如果一开始只是普通的龋痛，做了直接充填术出现了冷热的刺激性疼痛，并且疼痛是持续的，还有夜间的自发性疼痛，并且伴有耳颞部的放射性疼痛有可能是牙髓炎，需要做根管治疗。如果当时就做了根管治疗，做完根管充填以后，牙齿有叩痛、咬合痛或者浮胀感，考虑是牙根尖炎。如果是有冷热的刺激性疼痛，不排除是残髓炎。需要去除根管内的充填材料，重新的做根管治疗。
通常情况下，小孩牙疼时可以补牙。
如果牙冠发生龋坏，遇冷热刺激，孩牙疼痛可能会加重，一般可以营养去除腐坏牙体组织后，然后在窝洞深处用氢氧化钙进行护髓，或者可以使用丁香油氧化锌粘固剂暂封，在安抚牙髓，疼痛消失后，可以双层垫底充填窝洞。如果小孩牙疼一直持续或有进行性加重，一般需要在局麻下摘除牙髓或进行牙髓失活，拔除根髓，消毒、完成根管治疗后，再充填窝洞。
