如果胆囊穿孔，是一种非常严重的疾病。由于胆汁在胆囊中，是一种化学物质，如果胆囊破裂，会引起胆汁性腹膜炎、继发性细菌感染、败血症等严重并发症。因此一旦明确需要考虑及时的外科治疗，访问肝胆外科，不能延误治疗时间。
肝内胆管结石不能自愈，需要系统进行医学治疗，多继发于胆道系统感染或者有胆道蛔虫的病史，以及外伤之后导致的胆管损伤，或者先天性发育异常，有解剖胆管变异，容易导致胆汁淤积，继发形成结石。
肝内胆管结石和肝囊肿同时发生需要到正规医院接受治疗。如果肝内胆管结石呈淤泥状分布且直径相对较小，有时会随着胆汁代谢排出体外因此可以不用手术治疗。然而，如果结石的直径相对较大，并伴有明显的腹痛，需要手术治疗。因为直径较大时恶性转化的风险会相应增加。
胆道结石术后常规放置腹腔引流管，主要是用于观察腹腔手术范围内的渗血情况和有无胆瘘。一般在术后的3-5天内引流液相对清亮，大约在10ml左右，即可拔除。术后前几天腹腔引流量相对较大，引流液多为术中渗血，随着时间延长，渗血逐渐减少。
部分胆管结石病人，手术前后需要高纤维、低油脂饮食，全脂牛奶脂肪含量相对较高，可刺激肝胆管，术后不要马上喝牛奶。牛奶的消化吸收需胃肠道的正常菌群参与，肝胆管结石病人术后进食时间较晚，肠道菌群被破坏，空腹饮牛奶会造成消化道不适，易出现腹泻、腹胀等情况。
肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
