肠镜需要将器材进入身体，理论上属于有创检查，对于身体是有一定创伤的。因为在肠镜检查过程中可能会出现疼痛不适等症状，也有可能损伤肠道黏膜，导致黏膜的炎症和水肿，甚至导致出现肠穿孔。
做完肠镜之后不能吃海鲜的，检查完毕后饮食上要吃一些清淡易消化的流质饮食，以后逐渐恢复正常饮食建议喝点流质的食物，不要吃一些辛辣刺激性的食物，以免引起胃肠道不适的了。
一般做完肠镜都是建议4小时之后再进食物，进食那种比较清淡好消化的流食，会出现肚子疼，可能是做肠镜时候为了视野清晰，带入了气体，经过排气就会好转。如果单纯一侧手脚麻木，有可能是长时间一侧卧位压迫，或者精神紧张。
做肠镜当天出结果的，医生在完成结肠镜操作后，会对操作过程采集的照片进行阅片。一般每个部位都会采集照片。如在阅片中遇到不好诊断，一般会找上级医师寻求帮助，可能比较费时间，但一般都在半个小时内完成，如果没有什么异常，10分钟左右就可以拿到报告。
做完结肠镜后，充入的二氧化碳气体没有被完全放出来，有可能有些轻度腹胀，但慢慢就会好的。平时需要2个小时才能喝温水，如果没有任何不适，就可以进全流食。不要喝酒，碳酸饮料，茶，咖啡，也不要吃生、冷、硬、烫，刺激性食物。
