早上口苦口臭通常是口腔卫生不佳，牙周病等因素造成的。
如果早上有口苦、口臭的症状，通常是口腔卫生不良，或患有牙周病，干口症等疾病，或有吸烟习惯，或食用某种食品造成的。如果口臭症状还在继续，患者可以去口腔科就诊。需要注意的是，有些药物如高血压、精神科用药等也会引起口臭。患者平时也要注意少吃辛辣刺激、肥甘厚味之品，戒烟限酒，适当多喝水等。
每天晨起、睡前和饭后认真地刷牙漱口，必要时，用牙刷或洁净的毛巾轻柔地刷除舌苔。其次，戒烟戒酒；饮食要相对清淡，避免吃生冷、刺激性、有臭味（如蒜、葱、韭菜、臭豆腐等）及不易消化的、油腻的（高蛋白、高脂肪）食物；进食时要细嚼慢咽；多喝水，多食蔬菜水果及豆类；生活作息规律，保持心情舒畅；多参加体育锻炼。
如果口腔卫生比较健康，就是单纯的在晚上口腔内的细菌繁殖比较快所引起的。在夜间，口腔咀嚼运动比较弱，一般张口时间比较短，绝大多数都处于厌氧的环境，这样就很有利于口腔内细菌的繁殖。
大部分人早上起来都会有口臭，因为人的口腔中都有细菌，其中的厌氧菌在缺少氧气的环境中繁殖的特别快，在睡眠中因为不咀嚼，闭着嘴巴，有利于厌氧菌生长，厌氧菌在分解食物时就会发出难闻的味道，刷牙、漱口之后一般就会消除。如果伴有口苦，说明脾胃不健康、胃火旺，应该及时调理脾胃。
口中有明显的苦味，并伴有口干舌燥，两胁胀痛，小便短黄等症状，多见于中医辨证为肝胆湿热。临床上，急性肝炎、急性胆囊炎、急性尿道炎等肝胆湿热型的常常觉得口苦，服用医师指的药物等清热利湿、疏肝泄胆的中药，口苦的症状很快就获得改善。
晨起口臭，主要是胃食管反流症引发的，多数由于睡觉的时候会导致上消化道压力增高，引发大量的胃内容物反流到口腔内产生口苦口臭的症状，同时伴随有打嗝、反酸、嗳气、腹痛腹胀、咽喉或者胸骨后烧灼感等现象。