手术切除：1、手术切除是治疗肝囊肿有效的方法，其关键在与吸净囊液后将大部分囊壁或所有游离的囊壁切除。但手术切除创伤性较大。2、肝穿刺抽液：肝穿刺抽液法指的是在B超指引下，用细针将囊内液体吸出，然后注入无水酒精，以破坏分泌囊液的细胞。
对于肝囊肿的治疗是选择手术治疗为主，可以适当的选择观察肝脏的大小，是否有临床主要症状，定期观察就可以，如果直径大于五厘米或者临床主要症状比较明显，还需要适当的选择手术治疗。
肝囊肿是在肝脏生长过程中的病理表现，具体病因目前还不清楚，类似于人体表面痣、雀斑、疣等的形成，大部分的肝囊肿都不会引起临床症状，也无需特殊处理。认为本病是起源于肝内迷走胆管的一种滞留性囊肿，属于先天性发育异常，肝囊肿生长缓慢，多数病人无明显症状，仅在体检时被偶然发现，巨大的肝囊肿可出现明显的压迫症状。若合并感染，可出现畏寒、发热、腹痛等类似肝脓肿的症状。
囊肿是由一些上皮细胞排列组成的闭合性的腔隙。里面含有囊液，成分主要是水，所以肝囊肿生长的比较缓慢。绝大多数的病人是没有症状的，往往是在体检行彩超时发现。先天性的囊肿生长得非常的慢，可能是终生都没有症状，定期复查就可以了。
是由于肝内胆管胚胎发育障碍所致，也有一部分是脏器退行性病变所导致的。如果囊肿小于5cm，位于肝脏深部，没有明显的症状，没有出血等问题可以不治疗，定期超声观察就行。如果囊肿大于5cm，位于肝脏表面，有胀痛感等症状，可以考虑超声引导下介入穿刺，抽液。
