一般呈褐色，巧克力囊肿又叫做卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。子宫内膜是生长在子宫腔内的，受体内女性激素的影响，每月要脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随着经血逆流经过输卵管进入到盆腔，种植在卵巢表面或者盆腔的其他部位形成异位的囊肿。
正常月经的颜色是暗红色，若月经量少可能颜色较深或呈巧克力色，可能是异常情况。
若女性有同房建议确诊断是否怀孕，也可能是月经失调，建议及时就医。检查HCG值，若数值高于正常则是怀孕，但宫外孕或宫内孕，建议做盆腔的彩超检查明确诊断，如果考虑是宫外孕的可能，建议进一步检查。若彩超提示宫内有孕囊，可以进行保胎，监测HCG值和孕酮数值的变化，怀孕50天后复查彩超如果没有胎心，可能是胚胎停止发育，建议及时终止妊娠，若检查HCG数值正常，则不是怀孕而是月经失调。要根据彩超检查看子宫内膜的情况，若子宫内膜厚度没有异常，建议用孕激素治疗，若子宫内膜薄，建议用雌孕激素治疗，必要时检查激素水平6项，看卵巢功能是否正常。
月经颜色像巧克力色可能是生理现象，也可能是妇科疾病，需对症进行治疗，具体内容如下：
月经颜色像巧克力色，如果没有其他不适症状，可能是由于宫腔内的淤血未完全排除干净，一般为属于正常的生理现象，通常不需要进行特殊治疗，注意保持个人卫生即可。
但是如果症状持续时间较长，还伴有疼痛、瘙痒等症状，月经颜色像巧克力色可能是妇科疾病引起的，患者需要尽早去医院进行检查，明确具体病因后对症进行治疗。
卵巢内的经血越积多，会形成囊包，外观呈巧克力糊状，是形成卵巢巧克力囊肿的原因。卵巢巧克力囊肿可以在没有诱因情况下自发进行破裂，再经前期性生活，粗暴或剧烈时会导致囊肿破裂。
具有抗衰老、保护心血管，黑巧克力中天然抗氧化剂多酚的含量较高，其具有与阿司匹林相似的抗炎作用，在一定浓度下可以降低血小板的活化，还可以控制食欲，因为巧克力中所含的咖啡因有抑制食欲的作用，并能促进人体新陈代谢。
巧克力囊肿的形成，通常选择是微创术后喝蜂蜜和豆浆完全可以没有影响，但是要注意适量，尤其是蜂蜜容易引起肠蠕动增加，术后一个月以后再喝。注意休息，不要过劳，适当增加营养，注意刀口卫生，不要感染。应食用易于消化的食物。瘦肉，鲜鱼汤，奶制品，海鲜等。
