手术切除：1、手术切除是治疗肝囊肿有效的方法，其关键在与吸净囊液后将大部分囊壁或所有游离的囊壁切除。但手术切除创伤性较大。2、肝穿刺抽液：肝穿刺抽液法指的是在B超指引下，用细针将囊内液体吸出，然后注入无水酒精，以破坏分泌囊液的细胞。
肝囊肿能消除。适量运动根据天人合一的理论，肝囊肿患者要适当参加体育锻炼，如散步、慢跑、体操、太极拳等，保持体内的生机。情绪上要乐观，不宜抑郁或发怒，不要过分劳累，以免加重肝脏负担。
肝囊肿一般主要是注意并发症的发生，临床表现为忽然剧烈的腹痛及囊肿增大。这种并发症几乎均见于五十岁以上的妇女，但极少部分腹痛则较为轻微，甚至没有，出血时超声下观察到囊内容物呈流动性。另外囊肿破裂，囊内并发感染时，尚可出现寒战、高热；压迫十二指肠尚可形成内瘘；门脉高压等。
肝囊肿属于一个良性改变的一个情况，如果肝囊肿小于五公分以下，不需要口服药物，如果大于五公分以上，存在一个破裂出血的风险，这种可以考虑到医院及时的进行减压或者手术切除治疗。
一般比较早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿生长部位不影响患者生活，也可以不做处理。
