大部分的肛瘘的瘘管是由直肠肛管周围脓肿引起的，也可以由结肠炎，克罗恩病等特异性炎症，恶性肿瘤，肛管外伤感染引起，但比较少见。直肠肛管外伤继发感染也可形成肛瘘，直肠肛管恶性肿瘤也可溃破成瘘管，但都很少见，与一般化脓性肛瘘有明显区别。
是可以治的。但是否能治好要根据它的大小和部位决定，如果是小的良性的囊肿，可以不处理，如果直径超过5到6厘米，可以采取B超引导下细针穿刺的方法，抽取囊肿内的液体，注射硬化剂，防止囊肿再次生长。
临床表现急性腹膜炎经治疗体温又复升高，脉快。下腹部坠胀不适或钝痛，大便次数增多粘液便及里急后重等直肠刺激症状。可有尿频，急，痛等膀胱刺激症状。下腹有压痛，直肠指检括约肌松弛，直肠前壁饱满，触痛，有波动感。
低位脓肿会出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。直肠周围脓肿就不一定会疼痛。因为直肠周围属于盆腔，这里分布的植物神经对普通刺激不敏感，最主要表现是局部坠胀和便意感。肛周脓肿的另一症状就是发热。
盆腔脓肿的临床表现与急性子宫内膜炎和急性附件炎、急性盆腔结缔组织炎等相类似，难以鉴别，要重视病程演变过程。急性盆腔炎经适当和足量抗生素治疗48～72h，病情无好转，结合临床表现和辅助检查，不难明确诊断。
